(代理) 李健二教授(1997/02 - 1998/10)
(代理) 張保民教授(1998/11 - 2000/01)
第一屆 薛天棟教授(2000/02 - 2003/01)
(代理) 謝文真教授(2003/02 - 2003/08)
第二屆 陳振宇教授(2003/09 - 2005/07)
第三屆 陳振宇教授(2005/08 - 2008/07)
(代理) 黃煌煇教授(2008/08 - 2009/07)
第四屆 何志欽教授(2009/08 - 2012/07)
第五屆 何志欽教授(2012/08 - 2015/07)
第六屆 許育典教授(2015/08 - )